Benoît Peeters est né à Paris le 28 août 1956. Il vit à Bruxelles depuis 1978.
Après une licence de philosophie à la Sorbonne, il a préparé le diplôme de l'Ecole pratique des Hautes Etudes sous la direction de Roland Barthes.
Il publie son premier roman, Omnibus, aux Editions de Minuit en 1976 et se consacre entièrement à l'écriture à partir de 1982, multipliant les travaux dans les domaines du scénario, de la critique, de l'édition et de la conception d'expositions.
Spécialiste d'Hergé, il a publié Le Monde d'Hergé (Casterman, 1983) et Les Bijoux ravis, une lecture moderne de Tintin (Magic-Strip, 1984) et tout récemment une biographie saluée par la presse : Hergé, fils de Tintin (Flammarion).
Théoricien et critique, il a fait paraître de nombreux essais sur la bande dessinée, le scénario, le storyboard, mais aussi sur Hitchcock, Valéry et Nadar.
Une longue complicité avec François Schuiten lui a permis de construire avec lui le cycle des Cités obscures. Quinze albums (alternant bandes dessinées et récits illustrés) sont parus à ce jour ; ils ont obtenu de nombreux prix et ont été traduits dans une dizaine de langues.
Passionné par le récit sous toutes ses formes, et les rapports du texte et de l'image, Benoît Peeters collabore aussi avec d'autres dessinateurs (Alain Goffin, Anne Baltus, Frédéric Boilet), une photographe (Marie-Françoise Plissart), des musiciens (Didier Denis, Bruno Letort) et des cinéastes (Raoul Ruiz, Pierre Drouot).
Il a réalisé trois courts métrages, plusieurs documentaires et un long métrage, Le dernier plan. Il est également l'auteur de grands entretiens filmés avec Alain Robbe-Grillet.
Souvent avec François Schuiten, il a conçu plusieurs expositions dont Le Musée des Ombres, Hergé dessinateur, Au Tibet avec Tintin, Architectures rêvées, Les Métamorphoses de Nadar, Rêves de pierre, Le théâtre des images et Le Livre voyage.